MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSCV50

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006855	TTC	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006855	CTGC	2	8	135	142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006855	TGA	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006855	CAGC	2	8	235	242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006855	GTAAA	2	10	354	363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006855	GGC	2	6	394	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006855	GCA	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006855	TTG	2	6	490	495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006855	TTC	2	6	520	525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006855	TGC	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006855	CTA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006855	TTCG	2	8	704	711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006855	TAA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006855	T	6	6	855	860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006855	TCAAC	2	10	870	879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006855	ATT	2	6	905	910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006855	GTT	2	6	950	955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006855	CAT	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006855	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006855	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006855	A	10	10	1142	1151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006855	TAT	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115464
23	NC_006855	TAA	2	6	1175	1180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115464
24	NC_006855	A	6	6	1179	1184	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
25	NC_006855	AG	3	6	1290	1295	50 %	0 %	50 %	0 %	60115464
26	NC_006855	GAA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115464
27	NC_006855	AAC	2	6	1435	1440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115464
28	NC_006855	ATA	2	6	1446	1451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115464
29	NC_006855	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
30	NC_006855	A	6	6	1516	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
31	NC_006855	GAG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60115464
32	NC_006855	ATA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115464
33	NC_006855	GAA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115464
34	NC_006855	ACAA	2	8	1575	1582	75 %	0 %	0 %	25 %	60115464
35	NC_006855	ATT	2	6	1606	1611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115464
36	NC_006855	TTAT	2	8	1662	1669	25 %	75 %	0 %	0 %	60115464
37	NC_006855	A	6	6	1674	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	60115464
38	NC_006855	TTCT	2	8	1680	1687	0 %	75 %	0 %	25 %	60115464
39	NC_006855	T	7	7	1778	1784	0 %	100 %	0 %	0 %	60115464
40	NC_006855	GTTCA	2	10	1838	1847	20 %	40 %	20 %	20 %	60115464
41	NC_006855	ACA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115464
42	NC_006855	CCT	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115464
43	NC_006855	CAG	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115464
44	NC_006855	CAGATT	2	12	2101	2112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_006855	TCC	2	6	2127	2132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_006855	TGG	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006855	GAA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006855	GAAT	2	8	2299	2306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006855	GTT	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006855	GTT	2	6	2373	2378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006855	TGT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006855	CAG	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006855	ATAA	2	8	2452	2459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006855	AAT	2	6	2495	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006855	TCA	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006855	TTAT	2	8	2560	2567	25 %	75 %	0 %	0 %	60115465
57	NC_006855	ACC	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115465
58	NC_006855	ATT	3	9	2651	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115465
59	NC_006855	TTA	2	6	2696	2701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115465
60	NC_006855	GCA	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115465
61	NC_006855	CGG	2	6	2871	2876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115465
62	NC_006855	TGG	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115465
63	NC_006855	ATG	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115465
64	NC_006855	CTG	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115465
65	NC_006855	CTG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115465
66	NC_006855	AGC	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115465
67	NC_006855	AGC	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115465
68	NC_006855	CCGA	2	8	3148	3155	25 %	0 %	25 %	50 %	60115465
69	NC_006855	ACA	2	6	3161	3166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115465
70	NC_006855	CTGAC	2	10	3176	3185	20 %	20 %	20 %	40 %	60115465
71	NC_006855	CCG	2	6	3218	3223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115465
72	NC_006855	AGT	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006855	AGC	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006855	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006855	AGTC	2	8	3596	3603	25 %	25 %	25 %	25 %	60115466
76	NC_006855	GCGCTG	2	12	3671	3682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	60115466
77	NC_006855	CAG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115466
78	NC_006855	GGC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115466
79	NC_006855	GCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115466
80	NC_006855	CGGA	2	8	3807	3814	25 %	0 %	50 %	25 %	60115466
81	NC_006855	TGGG	2	8	3959	3966	0 %	25 %	75 %	0 %	60115466
82	NC_006855	GAT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115466
83	NC_006855	CTG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115466
84	NC_006855	CCG	2	6	4035	4040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115466
85	NC_006855	GCC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115466
86	NC_006855	GAG	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60115466
87	NC_006855	CGC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115466
88	NC_006855	GTG	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115466
89	NC_006855	CGCC	2	8	4375	4382	0 %	0 %	25 %	75 %	60115466
90	NC_006855	GCC	2	6	4437	4442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115466
91	NC_006855	CCA	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115466
92	NC_006855	TGA	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115466
93	NC_006855	CTG	3	9	4505	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115466
94	NC_006855	GCT	2	6	4550	4555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115466
95	NC_006855	AGA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115466
96	NC_006855	CAA	2	6	4600	4605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115466
97	NC_006855	GCCACC	2	12	4612	4623	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	60115466
98	NC_006855	CCT	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115466
99	NC_006855	GAT	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115466
100	NC_006855	CAAAAT	2	12	4659	4670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	60115466
101	NC_006855	TAA	2	6	4741	4746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115466
102	NC_006855	GAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115466
103	NC_006855	TGA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115466
104	NC_006855	TA	3	6	4862	4867	50 %	50 %	0 %	0 %	60115466
105	NC_006855	ACT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115466
106	NC_006855	TAATA	2	10	4987	4996	60 %	40 %	0 %	0 %	60115466
107	NC_006855	TGA	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115466
108	NC_006855	CTG	2	6	5235	5240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115466
109	NC_006855	AAT	2	6	5260	5265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115466
110	NC_006855	ACTCA	2	10	5278	5287	40 %	20 %	0 %	40 %	60115466
111	NC_006855	AGT	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006855	CTT	2	6	5417	5422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006855	T	6	6	5455	5460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006855	A	6	6	5469	5474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006855	A	8	8	5506	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006855	TAA	2	6	5529	5534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006855	AT	3	6	5542	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006855	AATCTA	2	12	5589	5600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	60115467
119	NC_006855	CCT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115467
120	NC_006855	GCT	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115467
121	NC_006855	ATG	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115467
122	NC_006855	AAT	2	6	5673	5678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115467
123	NC_006855	TCG	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115467
124	NC_006855	CAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115467
125	NC_006855	TA	3	6	6042	6047	50 %	50 %	0 %	0 %	60115467
126	NC_006855	ACCAG	2	10	6050	6059	40 %	0 %	20 %	40 %	60115467
127	NC_006855	CGT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115467
128	NC_006855	TGG	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60115467
129	NC_006855	TGA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115467
130	NC_006855	AGTA	2	8	6292	6299	50 %	25 %	25 %	0 %	60115467
131	NC_006855	TTA	2	6	6362	6367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006855	C	6	6	6399	6404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_006855	T	6	6	6496	6501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006855	ATATT	2	10	6507	6516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006855	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115468
136	NC_006855	A	6	6	6610	6615	100 %	0 %	0 %	0 %	60115468
137	NC_006855	AAT	3	9	6620	6628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115468
138	NC_006855	ATG	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115468
139	NC_006855	AG	3	6	6679	6684	50 %	0 %	50 %	0 %	60115468
140	NC_006855	ATA	2	6	6744	6749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115468
141	NC_006855	TAT	2	6	6780	6785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115468
142	NC_006855	ACAT	2	8	6804	6811	50 %	25 %	0 %	25 %	60115468
143	NC_006855	AT	3	6	6822	6827	50 %	50 %	0 %	0 %	60115468
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149	NC_006855	A	7	7	7144	7150	100 %	0 %	0 %	0 %	60115468
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163	NC_006855	CTTA	2	8	7700	7707	25 %	50 %	0 %	25 %	60115469
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167	NC_006855	AT	3	6	7840	7845	50 %	50 %	0 %	0 %	60115470
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268	NC_006855	CAG	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115476
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271	NC_006855	GCC	2	6	11907	11912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115476
272	NC_006855	GCA	2	6	11932	11937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115476
273	NC_006855	CTGC	2	8	11947	11954	0 %	25 %	25 %	50 %	60115476
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275	NC_006855	CT	3	6	11990	11995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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403	NC_006855	T	6	6	18125	18130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_006855	AT	3	6	18132	18137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_006855	TTGCA	2	10	18160	18169	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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407	NC_006855	T	7	7	18242	18248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_006855	TTTG	2	8	18277	18284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
412	NC_006855	AAAC	2	8	18320	18327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
413	NC_006855	TA	3	6	18333	18338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_006855	GTTT	2	8	18353	18360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
415	NC_006855	ATG	2	6	18410	18415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115485
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420	NC_006855	GT	3	6	18591	18596	0 %	50 %	50 %	0 %	60115485
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422	NC_006855	TCAG	2	8	18672	18679	25 %	25 %	25 %	25 %	60115485
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425	NC_006855	TGT	2	6	18718	18723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_006855	TTA	2	6	18822	18827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_006855	CGTCA	2	10	18861	18870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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430	NC_006855	AATGTG	2	12	18926	18937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_006855	A	6	6	18959	18964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_006855	TA	3	6	18980	18985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_006855	ATT	2	6	18999	19004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115486
434	NC_006855	ATT	2	6	19011	19016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115486
435	NC_006855	TGACC	2	10	19094	19103	20 %	20 %	20 %	40 %	60115486
436	NC_006855	GTT	2	6	19137	19142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115486
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441	NC_006855	TTTA	2	8	19532	19539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_006855	CGG	2	6	19554	19559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_006855	GTT	2	6	19585	19590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NC_006855	TTA	2	6	19654	19659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_006855	TCC	2	6	19695	19700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
446	NC_006855	GTT	2	6	19726	19731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_006855	TCA	2	6	19740	19745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115487
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449	NC_006855	TAT	2	6	19897	19902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60115487
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452	NC_006855	CTG	2	6	20404	20409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115487
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